ATAC-seq
Este módulo introduz a análise de ATAC-seq, uma técnica utilizada para identificar regiões de cromatina acessível no genoma.
Dados de ATAC-seq permitem investigar elementos regulatórios como promotores, enhancers e regiões de ligação de fatores de transcrição.
Objetivos do módulo
Ao final deste módulo, os participantes deverão ser capazes de:
- compreender o princípio experimental do ATAC-seq
- interpretar perfis de acessibilidade cromatínica
- entender as principais etapas da análise computacional
- explorar dados de acessibilidade genômica
Estrutura do módulo
- Teoria – fundamentos de acessibilidade cromatínica e regulação gênica
- Sessão prática – exploração de dados de ATAC-seq
- Exercícios – atividades práticas com os dados
- Referências – leituras e recursos adicionais
Conteúdo abordado
- acessibilidade da cromatina
- identificação de picos de ATAC-seq
- anotação de regiões regulatórias
- integração com dados de expressão gênica
- visualização de regiões regulatórias