CUT&RUN
Este módulo apresenta a análise de dados de CUT&RUN, uma técnica utilizada para mapear interações entre proteínas e DNA no genoma.
CUT&RUN é frequentemente usado para identificar regiões de ligação de fatores de transcrição ou modificações de histonas.
Objetivos do módulo
Ao final deste módulo, os participantes deverão ser capazes de:
- compreender o princípio experimental do CUT&RUN
- interpretar perfis genômicos de ligação proteína‑DNA
- reconhecer as etapas principais da análise computacional
- explorar dados genômicos de fatores regulatórios
Estrutura do módulo
- Teoria – princípios de regulação epigenética e ligação proteína‑DNA
- Sessão prática – análise guiada de dados de CUT&RUN
- Exercícios – atividades para interpretação dos resultados
- Referências – leituras adicionais
Conteúdo abordado
- mapeamento de regiões de ligação de proteínas
- identificação de picos genômicos
- anotação de regiões regulatórias
- integração com dados de expressão gênica
- interpretação de perfis regulatórios