Transcriptomics (RNA-seq)
Esse módulo é uma introdução para análises de sequenciamento de RNA (RNA-seq), um método para quantificar expressão gênica em amostras biológicas.
Vamos introduzir conceitos-chave e uma sessão prática de análise de RNA-seq.
Objetivos
Após a conclusão desse módulo, os alunos devem ser capazes de:
- compreender princípios básicos de experimentos de RNA-seq
- reconhecer os principais passos da análise de RNA-seq
- realizar análises exploratórias de dados de transcriptoma
Estrutura do módulo
Esse módulo inclui:
- Teoria: princípios biológicos e computacionais de RNA-seq
- Sessão prática: análise guiada de dados
- Exercícios: atividades para fixação e desenvolvimento do projeto
- Referências: recursos adicionais e recomendações de leitura
Conteúdo
- desenho experimental em RNA-seq
- controle de qualidade de dados de sequenciamento
- alinhamento de reads
- quantificação de expressão gênica
- análises exploratórias e expressão diferencial
- interpretação de resultados